Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCLAFQ15004 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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