Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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