Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
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