Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRCAPQ14761 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCAPQ14761 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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