Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1BQ14684 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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