Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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