Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK13Q14004 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
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