Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPSQ13938 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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