Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms