Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XRCC4Q13426 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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