Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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SKP2Q13309 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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SKP2Q13309 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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SKP2Q13309 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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SKP2Q13309 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP2Q13309 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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