Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NR5A1Q13285 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms