Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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