Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME3Q13232 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME3Q13232 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME3Q13232 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME3Q13232 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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