Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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RPA4Q13156 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RPA4Q13156 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RPA4Q13156 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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