Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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