Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC16Q13042 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms