Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFX1Q12986 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFX1Q12986 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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