Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YJL049WYJL049W 1353 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 AEP2YMR282C 1743 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 PPZ1YML016C 2079 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ISW2YOR304W 3363 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 HCM1YCR065W 1695 nt3.71□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 HMG1YML075C 3165 nt3.71□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ULP1YPL020C 1866 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RVS161YCR009C 798 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YPD1YDL235C 504 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 LRS4YDR439W 1044 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 SEC4YFL005W 648 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 EPT1YHR123W 1176 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 NNF1YJR112W 606 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 GIM5YML094W 492 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RRT1YBL048W 312 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 MEI5YPL121C 669 nt3.71□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 UBP6YFR010W 1500 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 LRG1YDL240W 3054 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 SPT10YJL127C 1923 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 SPT23YKL020C 3249 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 HOM2YDR158W 1098 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 BTT1YDR252W 450 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 TMA20YER007C-A 546 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 FMP32YFL046W 624 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 VMA21YGR105W 234 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YIP1YGR172C 747 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YHI9YHR029C 885 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 IRC18YJL037W 675 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 IME1YJR094C 1083 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YKL115CYKL115C 393 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 SWC7YLR385C 399 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RLP7YNL002C 969 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YPT53YNL093W 663 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 DIB1YPR082C 432 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 snR24snR24 89 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 HFD1YMR110C 1599 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 MLH2YLR035C 2088 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RAD4YER162C 2265 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 ZDS1YMR273C 2748 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 KRE2YDR483W 1329 nt3.7□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 CLB3YDL155W 1284 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 snR84snR84 550 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YGL108CYGL108C 423 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 MTC3YGL226W 372 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 THG1YGR024C 714 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YGR290WYGR290W 444 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 QCR10YHR001W-A 234 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YHR097CYHR097C 1101 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 TPK3YKL166C 1197 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YMR254CYMR254C 309 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 TSR4YOL022C 1227 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 ADF1YCL058W-A 342 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 ARO1YDR127W 4767 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YGR117CYGR117C 1431 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 TRM82YDR165W 1335 nt3.69□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 TRK1YJL129C 3708 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 UTP25YIL091C 2166 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 NSE4YDL105W 1209 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 MRPL49YJL096W 486 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 BET5YML077W 480 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 SIL1YOL031C 1266 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 ATP19YOL077W-A 207 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 PET123YOR158W 957 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RCN2YOR220W 798 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 NIP7YPL211W 546 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YSH1YLR277C 2340 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 OSH2YDL019C 3852 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 GCN5YGR252W 1320 nt3.68□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 MCP2YLR253W 1710 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RSF2YJR127C 4143 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 THR4YCR053W 1545 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 snR5snR5 204 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 SLU7YDR088C 1149 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 SYS1YJL004C 612 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YJR087WYJR087W 351 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YJR157WYJR157W 363 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 PRM6YML047C 1059 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 UTP23YOR004W 765 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 PHO88YBR106W 567 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RAD2YGR258C 3096 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YBP2YGL060W 1926 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 VPS33YLR396C 2076 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 HOS3YPL116W 2094 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RDH54YBR073W 2877 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 FAA1YOR317W 2103 nt3.67□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 BCK2YER167W 2556 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YPR022CYPR022C 3402 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RSC3YDR303C 2658 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YDR018CYDR018C 1191 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 ATP5YDR298C 639 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 ECM11YDR446W 909 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 MCA1YOR197W 1299 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.66□□□□□ -1.82
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