Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	BAG7	YOR134W	1230 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	NSA1	YGL111W	1392 nt		2.84	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SLI1	YGR212W	1407 nt		2.84	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	LRG1	YDL240W	3054 nt		2.84	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ECM21	YBL101C	3354 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ERP3	YDL018C	678 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	CGR1	YGL029W	363 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	EPT1	YHR123W	1176 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SNX4	YJL036W	1272 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	GCD14	YJL125C	1152 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	AIM26	YKL037W	357 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RPL6A	YML073C	531 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RPL20A	YMR242C	519 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	PNO1	YOR145C	825 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YOR385W	YOR385W	873 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	CSH1	YBR161W	1131 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YJR061W	YJR061W	2808 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	MTL1	YGR023W	1656 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	HUL5	YGL141W	2733 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YCR016W	YCR016W	873 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YCR085W	YCR085W	354 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RPL27A	YHR010W	411 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	PPX1	YHR201C	1194 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SKG1	YKR100C	1068 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RPA43	YOR340C	981 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	LCL1	YPL056C	306 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ICS2	YBR157C	768 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	MRS2	YOR334W	1413 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SRP68	YPL243W	1800 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YDL199C	YDL199C	2064 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RRP42	YDL111C	798 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YGR064W	YGR064W	369 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	PTI1	YGR156W	1278 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	THP2	YHR167W	786 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ARG3	YJL088W	1017 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	TDA8	YAL064C-A	381 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	PML39	YML107C	1005 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	AFT2	YPL202C	1251 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	UBS1	YBR165W	834 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YBR292C	YBR292C	372 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ADY4	YLR227C	1482 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	HEH2	YDR458C	1992 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	CYR1	YJL005W	6081 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	EPL1	YFL024C	2499 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SPT15	YER148W	723 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	PEX14	YGL153W	1026 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YGR114C	YGR114C	390 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	DOG1	YHR044C	741 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YIL161W	YIL161W	708 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RNH203	YLR154C	333 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RDN58-1	RDN58-1	158 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RDN58-2	RDN58-2	158 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	MTG1	YMR097C	1104 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	snR42	snR42	351 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RGC1	YPR115W	3252 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	RRP14	YKL082C	1305 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ARI1	YGL157W	1044 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	MPC3	YGR243W	441 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YHR022C	YHR022C	771 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YHR097C	YHR097C	1101 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	COX23	YHR116W	456 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ALB1	YJL122W	528 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YML090W	YML090W	387 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YNL109W	YNL109W	546 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	MIP6	YHR015W	1980 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	UTP14	YML093W	2700 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SST2	YLR452C	2097 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	FIN1	YDR130C	876 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SMT3	YDR510W	306 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YFR032C-B	YFR032C-B	264 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	PFS1	YHR185C	714 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	AGE2	YIL044C	897 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YIL174W	YIL174W	228 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SYS1	YJL004C	612 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	ATG34	YOL083W	1239 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	VAM3	YOR106W	852 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	SKT5	YBL061C	2091 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	YIL169C	YIL169C	2988 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	CDC55	YGL190C	1581 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VIK1	Q12045	EBS1	YDR206W	2655 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	RPS14A	YCR031C	414 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	PIR1	YKL164C	1026 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	MCA1	YOR197W	1299 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	EXO70	YJL085W	1872 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	PKP2	YGL059W	1476 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	PIN4	YBL051C	2007 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YDR131C	YDR131C	1671 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	GYP7	YDL234C	2241 nt		2.76	□□□□□ -1.97

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