Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EP300Q09472 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EP300Q09472 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EP300Q09472 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EP300Q09472 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EP300Q09472 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EP300Q09472 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EP300Q09472 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EP300Q09472 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EP300Q09472 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EP300Q09472 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EP300Q09472 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EP300Q09472 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EP300Q09472 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EP300Q09472 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EP300Q09472 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EP300Q09472 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms