Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms