Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms