Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms