Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms