Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms