Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF2Q01130 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF2Q01130 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF2Q01130 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF2Q01130 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF2Q01130 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF2Q01130 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF2Q01130 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms