Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2BQ00403 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms