Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAMQ00059 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms