Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRB1P82279 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRB1P82279 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRB1P82279 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRB1P82279 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRB1P82279 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRB1P82279 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRB1P82279 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRB1P82279 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CRB1P82279 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRB1P82279 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRB1P82279 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRB1P82279 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms