Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms