Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM4P67936 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM4P67936 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM4P67936 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM4P67936 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPM4P67936 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPM4P67936 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPM4P67936 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM4P67936 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM4P67936 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms