Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERVK_113P63132 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P63132 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms