Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VBP1P61758 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VBP1P61758 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VBP1P61758 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms