Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms