Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00310P59036 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms