Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPTEP56180 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPTEP56180 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPTEP56180 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPTEP56180 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPTEP56180 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPTEP56180 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPTEP56180 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms