Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC13P55735 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC13P55735 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC13P55735 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC13P55735 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC13P55735 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC13P55735 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC13P55735 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms