Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHBP55084 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHBP55084 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHBP55084 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHBP55084 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHBP55084 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHBP55084 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHBP55084 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHBP55084 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHBP55084 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHBP55084 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHBP55084 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms