Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D1P54289 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms