Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRYBA4P53673 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms