Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6CP51160 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms