Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP1P50238 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms