Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms