Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX1P48742 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHX1P48742 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX1P48742 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX1P48742 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX1P48742 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX1P48742 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX1P48742 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms