Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA4P43681 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA4P43681 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA4P43681 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA4P43681 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA4P43681 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA4P43681 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA4P43681 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms