Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSG1P42857 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NSG1P42857 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NSG1P42857 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NSG1P42857 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSG1P42857 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSG1P42857 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NSG1P42857 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NSG1P42857 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms