Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms