Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYH11P35749 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYH11P35749 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYH11P35749 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYH11P35749 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYH11P35749 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYH11P35749 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYH11P35749 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYH11P35749 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYH11P35749 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYH11P35749 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYH11P35749 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYH11P35749 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYH11P35749 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYH11P35749 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYH11P35749 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms