Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms